این دانشگاه با موافقت وزارت فرهنگ و آموزش عالی وقت در سال 1371 تاسیس شد(نام سابق: مرکز تحصیلات تکمیلی در علوم پایه زنجان). هدف دانشگاه، ایجاد یک محیط آموزش پیشرو و جو پژوهشی پویا است، که در آن آموزش علوم پایه در عالی‌ترین سطح با پژوهش بنیادی و کاربردی همراه باشد. دانشگاه از نظر آموزشی عمدتاً به تربیت دانشجو در مقاطع کارشناسی ارشد و دکتری در علوم پایه و به طور محدود در مقطع کارشناسی رشته‌ی فناوری اطلاعات می‌پردازد. از نظر فعالیت‌های علمی، فنی و فرهنگی با موسسات آموزشی و صنایع منطقه همکاری دارد و در ارتقای سطح عمومی و علمی منطقه و کشور سهیم است. ارتباطات و همکاری‌های بین‌المللی دانشگاه وسیع و دو طرفه است.
   امکان دسترسی دانشجویان در تمام ساعات شبانه روز به اساتید تمام وقت مقیم زنجان و تسهیلات آموزشی و پژوهشی دانشگاه، از مشخصات منحصر به فرد تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان است.