با پیگیری‌های سومین شهید محراب حضرت آیت‌الله صدوقی (ره) در ۲۳ بهمن‌ ماه سال ۱۳۶۷ دانشگاه یزد به‌ عنوان اولین دانشگاه جامع کشور بعد از انقلاب اسلامی با پذیرش ۳۸ نفر دانشجو در مقطع کارشناسی رسماً کار خود را آغاز کرد. در مهر ماه سال ۱۳۷۰ دانش‌سرای عالی یزد در دانشگاه یزد ادغام شد. از آن زمان تاکنون هماهنگ با گسترش و ارتقای سطح کیفی فعالیت‌های علمی و آموزشی، توسعه فیزیکی دانشگاه به‌ طور جدی در دستور کار مدیران و برنامه‌ریزان این مجموعه قرارگرفته است.

گزیده‌ای از افتخارات دانشگاه

کسب رتبه‌های برتر در همایش‌ها، جشنواره‌ها و المپیادهای ملی و بین‌المللی

انتخاب سه نفر از استادان این دانشگاه به عنوان دانشمندان پراستناد جهان

قبولی بیش از ۶۰ درصد دانش‌آموختگان دانشگاه در مقاطع تحصیلی بالاتر

کسب رتبه‌های برتر در آزمون‌های سراسری کارشناسی ارشد و دکترا

به انجام رساندن بیش از ۶۰ طرح پژوهشی 

انتشار ۱۵۰ عنوان کتاب

انتشار ۱۱ عنوان نشریه علمی پژوهشی

راه‌اندازی اولین موتور جست‌‌و‌جوی فارسی با نام پارسی‌جو

نوآوری در زمینه محصولات زیست‌فناوری